22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5974 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  902    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  28.91 
 
 		 395 aa  97.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  31.23 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  41.6 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  31.79 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  35.34 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  35.29 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35260  hypothetical protein  44.3 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  33.97 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  33.95 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1416  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  39.37 
 
 		 900 aa  55.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.322339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  29.38 
 
 		 452 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  31.03 
 
 		 351 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  28.29 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  26.69 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2928  pseudouridine synthase  19.43 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  41.67 
 
 		 250 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  34.42 
 
 		 245 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  34.86 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  30.67 
 
 		 1197 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  25.57 
 
 		 809 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  26.67 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>