11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35260  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  31.68 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  31.65 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  36.26 
 
 		 467 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  29.91 
 
 		 441 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  35.33 
 
 		 452 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  33.09 
 
 		 431 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  36.54 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  29.06 
 
 		 428 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  31.58 
 
 		 817 aa  42.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>