16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0374 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0374  hypothetical protein  100 
 
 		 738 aa  1327    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0650297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  42.22 
 
 		 2449 aa  71.6  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  37.46 
 
 		 971 aa  67.8  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  40.5 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  21.96 
 
 		 827 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  33.67 
 
 		 680 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  33.98 
 
 		 750 aa  52.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  45.39 
 
 		 2397 aa  52  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 723 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  19.96 
 
 		 1186 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.29 
 
 		 721 aa  50.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0522  RNA-binding S4 domain protein  34.85 
 
 		 698 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  36.68 
 
 		 717 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  40.99 
 
 		 304 aa  48.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  37.24 
 
 		 349 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 689 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>