14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1328 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  799    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2204  hypothetical protein  75 
 
 		 696 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00429968  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  29.89 
 
 		 2914 aa  75.5  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.26 
 
 		 2449 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  45.45 
 
 		 631 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  43.9 
 
 		 136 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1186  hypothetical protein  39.71 
 
 		 184 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1875  hypothetical protein  38.46 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.713684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  47.76 
 
 		 99 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  42.86 
 
 		 233 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  43.37 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  29.12 
 
 		 2851 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  38.98 
 
 		 1941 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32410  hypothetical protein  43.06 
 
 		 113 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.763333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>