34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2754 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  48.05 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  36.27 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  47.13 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01350  hypothetical protein  43.48 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1002  hypothetical protein  47.44 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145256  normal  0.324413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2501  hypothetical protein  31.96 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1875  hypothetical protein  41.56 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.713684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  40 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  49.09 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  38.64 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  47.27 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  65.79 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  65.79 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  65.79 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  65.79 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1186  hypothetical protein  27.57 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1010  hypothetical protein  30.53 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  60 
 
 		 347 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1421  hypothetical protein  32.24 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0767187  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  43.64 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34440  hypothetical protein  38.16 
 
 		 87 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0738844  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  48.78 
 
 		 316 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  45.45 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  48.78 
 
 		 350 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  43.37 
 
 		 425 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2204  hypothetical protein  41.89 
 
 		 696 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00429968  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1389  hypothetical protein  28.02 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000191938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1579  DivIVA family protein  46.81 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1578  DivIVA family protein  46.81 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10190  hypothetical protein  29.08 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13520  DivIVA protein  38.81 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  52.38 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32410  hypothetical protein  37.08 
 
 		 113 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.763333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>