47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  66.19 
 
 
224 aa  260  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  65.89 
 
 
204 aa  256  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  64.62 
 
 
205 aa  247  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  50 
 
 
238 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1578  DivIVA family protein  44.24 
 
 
232 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1579  DivIVA family protein  43.98 
 
 
228 aa  148  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10880  DivIVA protein  39.17 
 
 
237 aa  134  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00392112  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13520  DivIVA protein  43.37 
 
 
195 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  35.15 
 
 
302 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  34.36 
 
 
285 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  33.62 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  32.89 
 
 
347 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  32.37 
 
 
289 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  35.11 
 
 
270 aa  91.7  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  34.67 
 
 
271 aa  88.6  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  31.78 
 
 
254 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  32.13 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  29.12 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  31.17 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  27.89 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  29.96 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  32.87 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  29.25 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  29.25 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  29.25 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3191  DivIVA family protein  40.62 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  25.73 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  28.11 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  28.02 
 
 
276 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  30.37 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  35.58 
 
 
274 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  25.43 
 
 
281 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  65.79 
 
 
136 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  38.89 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0139  putative cell division initiation protein  52.38 
 
 
452 aa  49.3  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00239909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  40.3 
 
 
350 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16490  DivIVA protein  44 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.537974  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  45.45 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1410  DivIVA family protein  26.79 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000103103  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0760  cell division initiation protein  25.3 
 
 
289 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1117  DivIVA domain protein  32.1 
 
 
442 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09410  DivIVA protein  28.05 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0738055  normal  0.126085 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  25.56 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0597  DivIVA family protein  22.8 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000335111  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2228  DivIVA domain protein  24.77 
 
 
257 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01350  hypothetical protein  46.15 
 
 
110 aa  41.6  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>