33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  100 
 
 		 99 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  53.66 
 
 		 631 aa  94.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32410  hypothetical protein  50.6 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.763333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0782  hypothetical protein  47.95 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0056  hypothetical protein  41.25 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0485848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0046  hypothetical protein  41.25 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.884886  hitchhiker  0.00802794 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0065  hypothetical protein  41.25 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425042  normal  0.0470908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0065  hypothetical protein  39.51 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  38.64 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  60.53 
 
 		 218 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  60.53 
 
 		 240 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  60.53 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  60.53 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  57.89 
 
 		 281 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  57.89 
 
 		 276 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  57.89 
 
 		 273 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  56.76 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  55.26 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  56.76 
 
 		 272 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  47.76 
 
 		 425 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  56.76 
 
 		 272 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  55.26 
 
 		 274 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  56.76 
 
 		 272 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2269  DivIVA domain protein  56.76 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  55.26 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  43.02 
 
 		 233 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  38.64 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  54.05 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1010  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2204  hypothetical protein  43.59 
 
 		 696 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00429968  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1389  hypothetical protein  41.94 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000191938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2585  hypothetical protein  39.06 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.13384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0654  hypothetical protein  44.62 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>