28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32410  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  233  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.763333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  50.6 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  50.62 
 
 
631 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0056  hypothetical protein  46.34 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0485848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0065  hypothetical protein  46.34 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425042  normal  0.0470908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0046  hypothetical protein  46.34 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.884886  hitchhiker  0.00802794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0782  hypothetical protein  46.25 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0065  hypothetical protein  41.98 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  39.05 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2501  hypothetical protein  41.77 
 
 
183 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  38.67 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1002  hypothetical protein  45.21 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145256  normal  0.324413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  43.06 
 
 
425 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1010  hypothetical protein  41.27 
 
 
179 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0114  hypothetical protein  38.81 
 
 
567 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.391457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1389  hypothetical protein  43.48 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000191938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1372  hypothetical protein  43.48 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  53.85 
 
 
266 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  52.5 
 
 
281 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  37.08 
 
 
214 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  56.41 
 
 
271 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1875  hypothetical protein  40.51 
 
 
385 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.713684  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  56.41 
 
 
270 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23550  hypothetical protein  37.88 
 
 
183 aa  40.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.186469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  51.28 
 
 
274 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  51.28 
 
 
276 aa  40  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  53.85 
 
 
273 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  51.28 
 
 
271 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>