20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1002 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1002  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145256  normal  0.324413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1875  hypothetical protein  65.28 
 
 
385 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.713684  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  47.44 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  43.24 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3403  hypothetical protein  53.23 
 
 
273 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0115989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  43.66 
 
 
631 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  42.11 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2585  hypothetical protein  40.85 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.13384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32410  hypothetical protein  45.21 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.763333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2204  hypothetical protein  47.83 
 
 
696 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00429968  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  51.28 
 
 
291 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01350  hypothetical protein  36.17 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  51.28 
 
 
285 aa  42  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  35.38 
 
 
425 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  51.28 
 
 
289 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  51.28 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  51.28 
 
 
292 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1186  hypothetical protein  44.44 
 
 
184 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  53.85 
 
 
347 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23550  hypothetical protein  35.59 
 
 
183 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.186469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>