16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23550  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  360  5.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.186469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1186  hypothetical protein  62.64 
 
 
184 aa  228  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1490  DivIVA domain repeat protein  61.67 
 
 
184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1010  hypothetical protein  52.22 
 
 
179 aa  191  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2501  hypothetical protein  54.35 
 
 
183 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10190  hypothetical protein  46.7 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1389  hypothetical protein  42.31 
 
 
194 aa  140  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000191938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1372  hypothetical protein  41.21 
 
 
194 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06790  hypothetical protein  40.11 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00129974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1421  hypothetical protein  42.37 
 
 
195 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0767187  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0449  DivIVA domain repeat protein  29.32 
 
 
503 aa  76.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.148469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0114  hypothetical protein  28.65 
 
 
567 aa  75.9  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.391457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  32.28 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2585  hypothetical protein  27.84 
 
 
164 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.13384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  29.46 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  38.71 
 
 
631 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>