32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4396 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  100 
 
 
233 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  48.05 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  35.71 
 
 
631 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01350  hypothetical protein  43.43 
 
 
110 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  41.86 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  71.05 
 
 
292 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  71.05 
 
 
280 aa  62  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  71.05 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  68.42 
 
 
291 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  68.42 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  63.41 
 
 
347 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1875  hypothetical protein  44.58 
 
 
385 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.713684  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  57.89 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1002  hypothetical protein  42.11 
 
 
85 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145256  normal  0.324413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34440  hypothetical protein  41.25 
 
 
87 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0738844  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  43.02 
 
 
99 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0139  putative cell division initiation protein  45.28 
 
 
452 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00239909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  57.89 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  51.22 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  51.22 
 
 
350 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  42.86 
 
 
425 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  53.66 
 
 
247 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32410  hypothetical protein  38.67 
 
 
113 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.763333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  48.15 
 
 
302 aa  46.2  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2204  hypothetical protein  38.75 
 
 
696 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00429968  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1579  DivIVA family protein  41.38 
 
 
228 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3191  DivIVA family protein  48.84 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  55.26 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1117  DivIVA domain protein  48.72 
 
 
442 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  42.59 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2501  hypothetical protein  44.44 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1578  DivIVA family protein  38.6 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>