17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1875 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1875  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.713684  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1002  hypothetical protein  65.28 
 
 
85 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145256  normal  0.324413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3403  hypothetical protein  48.68 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0115989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  44.58 
 
 
233 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  41.56 
 
 
214 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  36.78 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1864  hypothetical protein  42.03 
 
 
199 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0671481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2204  hypothetical protein  40.91 
 
 
696 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00429968  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  50.91 
 
 
631 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  38.81 
 
 
136 aa  46.2  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0139  putative cell division initiation protein  52.38 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00239909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  50 
 
 
291 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  50 
 
 
280 aa  43.5  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  50 
 
 
292 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1186  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  50 
 
 
289 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  50 
 
 
285 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>