33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1117 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1117  DivIVA domain protein  100 
 
 		 442 aa  881    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0139  putative cell division initiation protein  59.07 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00239909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  47.52 
 
 		 1197 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  31.86 
 
 		 224 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  31.43 
 
 		 247 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  39.29 
 
 		 238 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  47.62 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  50 
 
 		 204 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  35.42 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1348  DivIVA family protein  42.42 
 
 		 153 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254169  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10880  DivIVA protein  37.14 
 
 		 237 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00392112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1579  DivIVA family protein  45.24 
 
 		 228 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1578  DivIVA family protein  45.24 
 
 		 232 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  26.36 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1264  DivIVA family protein  35.64 
 
 		 209 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.746002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  29.82 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  31.03 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  34.57 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  48.72 
 
 		 136 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  34.88 
 
 		 292 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  34.57 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  39.06 
 
 		 280 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  27.54 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  26.32 
 
 		 266 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  25.58 
 
 		 274 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  59.38 
 
 		 302 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  48.72 
 
 		 233 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  36.21 
 
 		 220 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1297  DivIVA domain protein  37.66 
 
 		 168 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  26.47 
 
 		 240 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  45.24 
 
 		 289 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  53.12 
 
 		 350 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  53.12 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>