13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_01350  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  219  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34440  hypothetical protein  41.58 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0738844  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  43.43 
 
 
233 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  43.48 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  38.89 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  55.26 
 
 
238 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0255  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.170158  normal  0.946354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  43.18 
 
 
224 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  45 
 
 
204 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  48.72 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1002  hypothetical protein  36.17 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145256  normal  0.324413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  52.63 
 
 
220 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1875  hypothetical protein  35.37 
 
 
385 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.713684  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>