13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2585 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2585  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  331  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.13384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2501  hypothetical protein  31.25 
 
 
183 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1490  DivIVA domain repeat protein  29.71 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1186  hypothetical protein  28 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  32.75 
 
 
631 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1421  hypothetical protein  28.98 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0767187  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1002  hypothetical protein  40.85 
 
 
85 aa  48.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145256  normal  0.324413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3403  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0115989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4395  hypothetical protein  32.98 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06790  hypothetical protein  28.87 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00129974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0654  hypothetical protein  31.85 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0782  hypothetical protein  36.49 
 
 
89 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  39.06 
 
 
99 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>