23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6286 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  460  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  34.17 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  32.6 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  55.74 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.08 
 
 		 2449 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2056  hypothetical protein  45.24 
 
 		 80 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  36.76 
 
 		 86 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  47.73 
 
 		 95 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  42.19 
 
 		 89 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  35.62 
 
 		 92 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  35.62 
 
 		 92 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  37.31 
 
 		 81 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  38.33 
 
 		 99 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  41.79 
 
 		 82 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  31.51 
 
 		 92 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  39.71 
 
 		 82 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  29.81 
 
 		 2397 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  29.58 
 
 		 100 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  35.85 
 
 		 91 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>