26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1719 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 92 aa  190  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  93.41 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  93.41 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  87.04 
 
 		 100 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  58.23 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  57.14 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  57.14 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  55.56 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  53.42 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  48.72 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  44.74 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  46.27 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  48.15 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  53.19 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  47.83 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  39.73 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  33.78 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  44.68 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  38.46 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  30.88 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  35.85 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  35.85 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  27.4 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  34.62 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>