16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4937 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  56.82 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  47.17 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  46.51 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  31.08 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  42.65 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  43.48 
 
 		 272 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  45.24 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  52.63 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  41.3 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  43.18 
 
 		 264 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3542  hypothetical protein  47.22 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2056  hypothetical protein  48.65 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  29.73 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>