32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1105 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  340  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  40.38 
 
 		 272 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  42.55 
 
 		 264 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  44.9 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2498  cysteine-rich repeat-containing protein  27.52 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  45.45 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 85 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  30.77 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  40.82 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  32.47 
 
 		 92 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  32.47 
 
 		 92 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  37.74 
 
 		 92 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  37.74 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2056  hypothetical protein  37.25 
 
 		 80 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  39.13 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  52.63 
 
 		 99 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  41.86 
 
 		 82 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  28.03 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  47.62 
 
 		 76 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3542  hypothetical protein  47.37 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  38.24 
 
 		 74 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  43.9 
 
 		 89 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  31.15 
 
 		 86 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  33.87 
 
 		 69 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  38.27 
 
 		 240 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  40.32 
 
 		 80 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>