14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2498 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2498  cysteine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 169 aa  347  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6950  hypothetical protein  30.2 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  34.38 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5113  putative cysteine rich repeat domain protein  27.63 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  24.83 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3542  hypothetical protein  30.21 
 
 		 129 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6142  hypothetical protein  26.27 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.0609846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  25.24 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  41.86 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  29.85 
 
 		 91 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  33.93 
 
 		 89 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  26.61 
 
 		 95 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  23.08 
 
 		 272 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  25.3 
 
 		 264 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>