37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1341 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  56.92 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  60.38 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  60.38 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  54.05 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  53.7 
 
 
100 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  49.09 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  44.16 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  47.89 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  47.89 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  47.22 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  46.27 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  47.17 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  45.76 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  45.76 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  41.82 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  38.6 
 
 
89 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  45.83 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  41.51 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  36.36 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  36 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  43.9  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  34.92 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  32.73 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  35.9 
 
 
74 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  32.05 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  31.58 
 
 
264 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  34.62 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  35.21 
 
 
272 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  38.57 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  34.92 
 
 
95 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  32.1 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  40.48 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>