27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0168 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  76.36 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  47.56 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  40.74 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  48.15 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  51.39 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  56.14 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  40.24 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  45.59 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  40.74 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  53.19 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  47.17 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  55.56 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  45.45 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  38.1 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  38.1 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.73 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  35.48 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  35.94 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  33.8 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  38.3 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  45.24 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  45.24 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  31.88 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  46.15 
 
 		 148 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  30.43 
 
 		 107 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>