12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0458 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 148 aa  296  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6950  hypothetical protein  32.33 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2498  cysteine-rich repeat-containing protein  34.38 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5113  putative cysteine rich repeat domain protein  27.41 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  32.32 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  52.17 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3542  hypothetical protein  30.11 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  38.6 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  28.03 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  46.15 
 
 		 81 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>