21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3450 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6950  hypothetical protein  39.02 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  51.11 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  52.08 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  47.17 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  46.77 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  38.1 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5113  putative cysteine rich repeat domain protein  33.78 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2056  hypothetical protein  47.5 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  32.91 
 
 
264 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6142  hypothetical protein  37.68 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.0609846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2498  cysteine-rich repeat-containing protein  30.88 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  35.21 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  37.88 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  31.58 
 
 
111 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  38.78 
 
 
245 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  32.47 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  34.92 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  31.67 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>