13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3542 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  253  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2498  cysteine-rich repeat-containing protein  30.21 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  27.73 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  34.44 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5113  putative cysteine rich repeat domain protein  29.7 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  41.38 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  47.37 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2582  hypothetical protein  36.07 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  39.06 
 
 		 240 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  37.14 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  28.57 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6950  hypothetical protein  28.05 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>