18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3779 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  52.08 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  56.1 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  41.67 
 
 		 264 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  46.51 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  38.57 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  46.43 
 
 		 272 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  42.19 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  36.11 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2056  hypothetical protein  40.85 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  40.35 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  38.6 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  40.62 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2498  cysteine-rich repeat-containing protein  33.93 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  43.9 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  35.29 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  37.74 
 
 		 87 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>