34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6274 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  62.2 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  62.2 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  62.96 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  55.26 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  54.17 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  49.33 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  54.17 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  53.42 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  47.56 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  51.79 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  50.72 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  54.9 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  52.63 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  53.33 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  53.33 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  41.51 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  39.62 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  38.98 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  33.82 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  46.15 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  37.88 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  32.1 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  29.07 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  38.64 
 
 		 88 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  29.73 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  30.56 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>