36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3800 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  45.45 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  38.98 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  53.66 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  42.86 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  38.71 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  40.35 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  42.65 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  46.67 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  43.18 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  33.87 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  35.06 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0458  cysteine-rich repeat-containing protein  45.83 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  38.81 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  36.76 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  40.82 
 
 		 240 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  34.21 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  40.3 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  35.21 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  34.29 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  36.92 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  32.81 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  42.55 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  35.48 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  38.24 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  37.14 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  39.29 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  35.9 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  43.48 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  39.13 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  36.11 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0292899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.779608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>