34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3599 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.779608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  62.22 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  41.33 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  41.33 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  45.16 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  57.78 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  38.03 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4905  hypothetical protein  48.84 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0292899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  35.21 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  35.62 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  42.31 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2010  hypothetical protein  39.68 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  33.85 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  40.38 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  37.7 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  38.46 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  36.49 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  37.31 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  32.35 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  41.3 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  32.31 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  29.51 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  39.13 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  35.29 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  34.78 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  42.55 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  31.25 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  30 
 
 		 80 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>