40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2012 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  64.23 
 
 
227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  56.72 
 
 
84 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  50.75 
 
 
88 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  67.39 
 
 
84 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  47.3 
 
 
84 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  48.33 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  49.28 
 
 
109 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  40.85 
 
 
87 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  50.98 
 
 
88 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  42.42 
 
 
94 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  42.39 
 
 
104 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  47.89 
 
 
103 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  40.51 
 
 
91 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  52.08 
 
 
101 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  38.03 
 
 
87 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  41.54 
 
 
85 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  36.62 
 
 
87 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2010  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  41.54 
 
 
92 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  36.62 
 
 
95 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  47.62 
 
 
111 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  41.94 
 
 
78 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  39.68 
 
 
92 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  40.98 
 
 
107 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  33.96 
 
 
83 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  41.1 
 
 
84 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2935  hypothetical protein  59.38 
 
 
77 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  40.82 
 
 
74 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  42.59 
 
 
81 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  39.13 
 
 
77 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.779608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  46.51 
 
 
83 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  35.94 
 
 
95 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4905  hypothetical protein  41.86 
 
 
83 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0292899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  35.94 
 
 
81 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>