34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3243 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  72.09 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  59.26 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  69.23 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  51.43 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  44.29 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  41.1 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  45.83 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  42.39 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  42.25 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  48.98 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  47.92 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  34.74 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  39.66 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  40.98 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  42.31 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.779608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  35.29 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  54.35 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  42 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  41.94 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2010  hypothetical protein  36.62 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  43.4 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  48.08 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  34.21 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  34.21 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2935  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  43.33 
 
 		 80 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  32.1 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>