35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2522 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  64.29 
 
 
88 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  57.89 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  58 
 
 
83 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  48.53 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  37.68 
 
 
88 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  37.68 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  47.17 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  43.64 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  36.76 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  43.55 
 
 
92 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  41.33 
 
 
80 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  43.75 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  52.38 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  41.1 
 
 
240 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  38.24 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  45.24 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  41.86 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  36.92 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  46.81 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  42.22 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  37.74 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  43.64 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  33.78 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  42.59 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  35.06 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  42.59 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  38 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  37.1 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  43.18 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>