38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2482 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  45.9 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  56.25 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  43.84 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  43.68 
 
 		 240 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  51.02 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  43.59 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  44.05 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  43.66 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  39.19 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  40.74 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  54.9 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  39.76 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  51.67 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  36.25 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  39.71 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  43.33 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  38.55 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  38.24 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  36.59 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  35 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  52.38 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  46 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  35.09 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  38.67 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2010  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  39.13 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  36.17 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  48.94 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  48.94 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  43.48 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4905  hypothetical protein  43.18 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0292899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2935  hypothetical protein  36.67 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>