28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4740 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  43.42 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  43.04 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  51.72 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  48.33 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  51.72 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  37.84 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  47.37 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  33.8 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  42.59 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  40.68 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  36.62 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  41.3 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  39.47 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  32.88 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  33.78 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  32.89 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  36.92 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  43.18 
 
 		 72 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  39.34 
 
 		 84 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  32.39 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>