38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1551 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  167  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  63.51 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  59.74 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  52.86 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  47.3 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  63.27 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  55 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  47.69 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  38.57 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  37.14 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  45.71 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  46.15 
 
 
109 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  54.35 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  48.15 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  59.52 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  44.78 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  54.35 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  52.17 
 
 
103 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  34.52 
 
 
111 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  37.88 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  40.82 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  44.83 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  35 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  32.88 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  39.62 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  37.14 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2935  hypothetical protein  53.33 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  47.62 
 
 
83 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  48.78 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  46.34 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  46.34 
 
 
87 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.22365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>