18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1716 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  72.5 
 
 		 80 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  82.46 
 
 		 79 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  69.84 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  62.96 
 
 		 81 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  57.97 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  69.23 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  49.35 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  52 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  62.22 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  39.19 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  43.42 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  64.29 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  41.56 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  48.98 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  40.68 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  32.05 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>