16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0119 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  87.5 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  66.67 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  59.46 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  49.35 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  58.33 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  42.11 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  42.5 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  46.34 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  64.44 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  55.36 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  53.06 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  39.47 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2498  cysteine-rich repeat-containing protein  41.86 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>