15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2273 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  173  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  71.76 
 
 
81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  72.88 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  58.82 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  56.47 
 
 
80 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  70.69 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  62.5 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  54 
 
 
76 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  64.44 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  64.44 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  66.67 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  55.56 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  35.8 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  55.56 
 
 
72 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  41.1 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>