45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0280 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  66.22 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  52.81 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  52.94 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  47.89 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  36.05 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  41.18 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  40.62 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  44.93 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  37.04 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  44.07 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  36.99 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  46 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  32.1 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  32.1 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  40.74 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  37.84 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  39.29 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  36.62 
 
 		 240 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  41.67 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  44.23 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2010  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  34.25 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  27.78 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4905  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0292899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.779608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  32.81 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  42 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  32.1 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  42.22 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  43.9 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  32.39 
 
 		 82 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  43.9 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  42.55 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  40.48 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  42.55 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  32.39 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  37.1 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>