33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3864 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  89.66 
 
 
87 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  88.51 
 
 
87 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  54.72 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  45.95 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  40.26 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  40.85 
 
 
240 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  37.04 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  46.15 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  41.54 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  38.03 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.779608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  50 
 
 
227 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  52.08 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  34.52 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  44.26 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  43.75 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4905  hypothetical protein  40.43 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0292899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  36.36 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  46.67 
 
 
74 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  46.81 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  45.65 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  39.06 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  37.88 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  43.48 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  39.73 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  46.51 
 
 
84 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  37.88 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  48.78 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  41.18 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  30.36 
 
 
85 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>