31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1886 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  76.36 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  49.33 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  54.24 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  48 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  52.54 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  48.48 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  48.33 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  40.24 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  47.27 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  47.27 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  47.22 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  53.19 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  47.83 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  44.07 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  40.68 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  39.13 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  39.13 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  38.03 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  32.88 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  41.1 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  37.93 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2056  hypothetical protein  36 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  32.89 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  40.58 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  37.88 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  32.43 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>