37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3790 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  98.85 
 
 
87 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  89.66 
 
 
87 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  56.6 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  41.33 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.779608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  46.15 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  38.03 
 
 
240 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  34.52 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  34.72 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  34.21 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  39.02 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  32.1 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  47.92 
 
 
227 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  41.1 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  40.98 
 
 
88 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4905  hypothetical protein  43.64 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0292899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  45.1 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  48.21 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  43.75 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  39.71 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  43.64 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  37.74 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  37.5 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  48.94 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  36.62 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  46.34 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  42.59 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  38.33 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  37.29 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  43.48 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  35.21 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2010  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  40  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  46.34 
 
 
84 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3823  hypothetical protein  47.37 
 
 
113 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.810845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>