31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0775 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0775  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  45.28 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  38.16 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4291  hypothetical protein  39.29 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  34.57 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3864  hypothetical protein  37.31 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0283748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  39.74 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  38.03 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  36.71 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3599  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.779608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  33.85 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2010  hypothetical protein  31.75 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  47.17 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  43.18 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  39.39 
 
 		 240 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  32.76 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4905  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0292899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  38.6 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  42 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  36.11 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0052  hypothetical protein  37.7 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  33.78 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  41.18 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  44 
 
 		 227 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  31.08 
 
 		 95 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>