27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2125 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  93.41 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  75 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  58.23 
 
 		 86 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  61.29 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  61.29 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  54.44 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  54.17 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  51.95 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  47.3 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  47.89 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  55.32 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  55.32 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  41.38 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  38.1 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  46.81 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  41.38 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  40.38 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  32.35 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  37.29 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  31.87 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  33.96 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  33.96 
 
 		 102 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  36.17 
 
 		 245 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>