26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4845 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  83.33 
 
 		 87 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  58.23 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  58.23 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  58.23 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  66.1 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  44.87 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  53.85 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  53.85 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  42.11 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  47.62 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  48.48 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  47.54 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  45.59 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  44.16 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  45.45 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  45.76 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  47.27 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  47.27 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  39.66 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  36.21 
 
 		 245 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  31.15 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>