26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5579 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  87.3 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  61.4 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  62.96 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  62.96 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  47.54 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  42.42 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  43.4 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  43.4 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  39.62 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  40.35 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  33.78 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  39.62 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  40.68 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  40.38 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  40.38 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  41.51 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  39.62 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  39.62 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  38.24 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  42.55 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  39.62 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  43.9 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  41.86 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>