31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0900 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  99.02 
 
 		 102 aa  200  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  85.29 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  83.08 
 
 		 97 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  60.34 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  56.9 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.18 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  40.51 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  40.51 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  32.86 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  32.35 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  32.35 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  32.89 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  29.55 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  35.42 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  42.67 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  31.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  32.43 
 
 		 95 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  34.78 
 
 		 82 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  39.34 
 
 		 175 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  36.84 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  33.85 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  30.77 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  28.89 
 
 		 93 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>