29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0873 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  83.87 
 
 
102 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  83.87 
 
 
102 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  80.33 
 
 
102 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  60.66 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  61.4 
 
 
72 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  41.79 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  39.47 
 
 
111 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  36.62 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  34.72 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  36.11 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  36.11 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1745  hypothetical protein  38.1 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.511357  normal  0.0185902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  34.72 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  32.53 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  33.77 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  35.71 
 
 
240 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  31.43 
 
 
95 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  38 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  35.42 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  32.89 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  37.21 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0936  hypothetical protein  36.67 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  39.34 
 
 
175 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>