30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0875 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  204  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  86.27 
 
 		 102 aa  146  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  85.29 
 
 		 102 aa  144  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  80 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  58.57 
 
 		 72 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  62.07 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  40.24 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  41.03 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  41.03 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.74 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  35.44 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  35.29 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  35.29 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  40.79 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  38.16 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  32.39 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  37.84 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0280  hypothetical protein  33.75 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  37.25 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2785  hypothetical protein  38.03 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  35.19 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  37.25 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  32.53 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  37.68 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  34.94 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663761  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  35.38 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3790  hypothetical protein  34.18 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.22365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3482  hypothetical protein  34.18 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>