29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1183 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  58.82 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  58.82 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  55.88 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  63.64 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  53.85 
 
 		 86 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  54.55 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  41.56 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  42.25 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  44.12 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  43.48 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  43.4 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  53.33 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  52.17 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  38.75 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  39.06 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  36.49 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  35.71 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  32.76 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  32.76 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  31.51 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  34.67 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  36 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  39.29 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  32.84 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6758  hypothetical protein  31.82 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>